Понимаешь, какое дело, православный христианин по идее должен все свои поступки соотносить со Священным Писанием и учением Святых Отцов.
Для христианина брак с язычницей возможен только лишь в случае, если она обещала принять православную веру. Других вариантов нет. А раз Дмитрий позволил себе вступить в брак с девушкой, исповедующей агностицизм, значит на тот момент он был христианином лишь номинально. Кстати, вполне возможно, что и жена его тоже когда-то была крещена в Православие. Но это не мешает ей сейчас не признавать Церковь и ее Таинства.
Поэтому я и предположил, что семейный конфликт у Димы возник на почве его неофитства, т. е. когда он уже по-настоящему стал членом Церкви. Другое дело, что он скорее всего допустил типичные для неофитов ошибки, запутавшись в потоке новой для него информации и начав активно воцерковлять свою жену.